Bioinformatique

L’équipe participe à la mise en place de pipeline, standard ou à façon.

1-Analyse de données NGS short-read (génomique, transcription et épigénétiques)

Analyse de données NGS short-read (génomique, transcription et épigénétiques).

Analyse de données de séquençage long-read (Oxford Nanopore Technologies).

Analyse de données de séquençage long-read (Oxford Nanopore Technologies).

Analyse de données multi-omics (Whole Génome, Exome, Bulk RNAseq, ScRNAseq, Methylome).

Analyse de données multi-omics (Whole Génome, Exome, Bulk RNAseq, ScRNAseq, Methylome).

Analyse fonctionnelle intégrée (annotation et voie de signalisation).

Analyse fonctionnelle intégrée (annotation et voie de signalisation).

Analyse bio-informatique en immuno-oncologie.

Analyse bio-informatique en immuno-oncologie.

Études GWAS et les analyses associées (eqtl analysis, TWAS, PRS).

Études GWAS et les analyses associées (eqtl analysis, TWAS, PRS).

Étude de biomarqueurs non invasifs de diagnostic et de pronostic

Étude de biomarqueurs non invasifs de diagnostic et de pronostic

Projets